本系設立於民國六十四年，初期定名為陶瓷玻璃科，民國七十二年經教育部核定改名為陶業工程科，遂將陶瓷、玻璃之無機材料皆納入陶業工程之範圍，再加上工程學門中原有之製程、檢驗、分析、品管、設計等內容，於是形成國內唯一之陶業工程科，於民國八十九年改名為陶瓷及材料工程系，投入高科技材料製造領域，民國九十二年更名為材料科學工程學系並同時設立 材料工程研究所碩士班。本系目前的發展方向為玻璃與陶瓷材料、半導體與奈米材料、光電高分子、薄膜製程、材料製程模擬、金屬鑄造等專業領域。

本系未來發展重點及方向包括：

陶瓷材料：感測元件、電子被動元件、壓電陶瓷元件之理論與應用、生醫陶瓷、燃料電池。

玻璃材料：光學模造玻璃、玻璃光纖、觸控玻璃、綠色玻璃、封裝玻璃、磁性玻璃。

奈米材料：奈米結構如奈米草、奈米線、奈米柱、AAO輔助奈米結構。

高分子材料：太陽能電池、電阻式記憶體、黏結劑系統。

半導體材料：閘極氧化層與電極、離子佈植、透明導電膜。

薄膜製程：超硬合金鍍膜、半導體製程技術。

精密製程技術與模擬：積層陶瓷製程技術、玻璃製程技術、材料製程模擬。